Desktop.ini представляет собой файл конфигурации и содержит параметры отображения текущей папки и некоторых ярлыков в ней (рабочий стол тоже является папкой).
Как правило, какой-либо критичной для работы системы информации в этом файле нет и, если вы его удалите обычными средствами Windows 10, проблем не будет — это безопасно. Однако, с большой вероятностью, через некоторое время после удаления файл появится в этом расположении снова.